La ermita se terminó de construir en el año 1699. En su construcción participó el pueblo de Alfara, apoyado por su parroquia.

A lo largo del tiempo se han llevado a cabo diversas restauraciones. La última intervención ha sido realizada entre los años 2006 y 2015 por la Cofradía de la Virgen de los Afligidos, de la localidad.

La Ermita está presidida por la imagen de Nuestra Señora de los Afligidos, Patrona de Alfara de la Baronia.

De estilo dórico, el edificio es de planta rectangular. El interior se dispone en una sola nave, con capillas laterales en los contrafuertes y arcos de punto redondo, y lunetos para iluminarlo. Su frontera es mixtilínea.

Su sencilla arquitectura y decoración configuran un edificio armónico